Nous acceptons toutes librairies compatibles avec la technologie illumina. Les librairies peuvent être issues d'ADN génomique pour du séquençage de génomes complets ou d'ARN pour une étude transcriptomique. Il peut également s'agir de librairies d'amplicons.

Pour être compatibles avec la technologie Illumina, les fragments d'ADN entrant dans la composition de la librairie devront comporter quatre élèments importants :

• les sites de fixation sur la flow-cell : séquences connues sous les noms P5 et P7 qui permettent la fixation des fragments composant la librairie sur la flow-cell et la clusterisation.
• les sites de fixation des primers de séquençage : séquences nécessaires à l'initiation du séquençage à partir de chaque extrémité du fragment d'intérêt.
• les index : courtes séquences (6-8 pb égénralement) appelées i5 et i7 qui servent de codes-barres pour permettre le multiplexage d'échantillons. L'utilisation de double indexage permet de séquencer un nombre plus important d'échantillons avec un nombre d'index uniques réduits. Par exemple, pour séquencer 96 échantillons en simple index, il faut 96 index différents alors qu'en double indexage, seulement 20 index différents sont nécessaires.
• les sites d'hybridation des primers permettant la lecture des index.

La combinaison de ces élèments constituant ce qu'on appelle les adaptateurs peut varier suivant la configuration en simple ou double index.

Si l'un des composants cités ci-dessus est modifié ou manquant, le client devra en faire part à Biomnigene qui adaptera les conditions de séquençage appropriées.

Oui, nous ajoutons gratuitement du Phix à vos librairies pour tous les séquençages réalisés sur nos appareils.

La librairie Phix sert en effet de contrôle interne de séquençage et elle apporte de la diversité dans les librairies.

La quantité de librairie Phix ajoutée dépend de la nature de votre librairie. Par exemple, pour une librairie d'ADN génomique, la quantité de Phix que nous conseillons de rajouter n'est que de 5%, alors que pour une librairie d'amplicons dont la diversité est moindre, cette quantité sera ajustée à 20-25%.

Oui, nous réalisons une électrophorèse capillaire afin de nous assurer que la taille de la libraire est homogène, ainsi que le dosage par fluorimétrie sur Qubit afin de vérifier la concentration déterminée par le client.